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統計リテラシー

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アオサとかキャベツとか

コロナ流行の初期に,感染防止に有効とされる食品がメディアに取り上げられました.覚えてますか?私の記憶によれば,納豆とかアオサとかがありました.アオサは某大学が公式に発表したものの,その研究のスポンサーがアオサのサプリを販売している会社だったことも問題視され,大学側が取り下げたはずです.一番問題だったのは,インフルエンザウィルスを使った実験結果でヒトコロナウィルスに対する増殖抑制効果を議論したことでしょうか.私のような素人でも乱暴と思いましたが,大学側の言い訳では,「ヒトコロナウィルスを含む各種ウィルスで効果があったから,新型コロナウィルスにも効くんじゃね.」としか言ってないのに,勝手に「新型コ...
統計リテラシー

コロナ時代のメディアリテラシー

最近の報道ではコロナ対策についての主張が二極化しています.以前から言われていた,コロナなんてただの風邪という意見と,現状の危機を認識しPCR検査を積極的に実施して,感染者を炙り出すことで,部分的にでもコミュニティをロックアウトせよという意見です.それに誘導されてでしょうか,私たちの間にもある意味対立が生じてしまっているのは残念なことです.二週間後には日本はどこどこの国のようになる・・・という従来からのマスコミの基調に乗せられている人々もいる一方で,渋谷ではクラスターフェスとかいうノーマスク,ノー自粛を標榜する団体の催しが開催されたりしています.そもそも,医療や政治あるいは経済の観点だけから最適...
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また抗体検査の話

一段と世の中が騒がしくなってきましたね.そんな中で菅,今日もブログだけは平常運転でいってみたいと思います.そうはいっても,特に書くこともないので,先週に引き続き,時事ネタを強引にJMPと紐付けてるという恒例のチャレンジをしてみます.先週は,横須賀市のコロナ抗体検査の結果の解釈に,統計的でもないのに「統計的に」という枕詞をつけるなと文句を言いました.そもそも「統計的に」という言葉をつける言説には,騙されるなという警告の意味があると解釈しています.さて,最近は,様々な自治体で同じ試みが実施されているようです.数日前のニュースでは宇都宮市でも無症状者を対象に抗体検査を実施したようです. ...
JMP

統計リテラシーと抗体検査

今日読んだニュースによれば(今日のニュースではありませんけど),インテルが7nm半導体の技術開発が予定より6カ月遅れていることを明らかにしたことで,株価が1割近く下がりました.Mac搭載のCPUとして毎日お世話になっていますけど,つい先日もAppleがCPUをインテル製から内製へと移行していく方針が発表されたばかりです.自社の製品開発のロードマップを他社の開発の遅れに妨げられないようにすることが目的と言われています.おそらく,インテルも今後は外部への生産委託を拡大する方向へ舵を取っていくことになると思いますが,同じ業界に長いこといて,かつての同僚のアメリカ人なども働いているので他人事のようには...
JMP

K値について思うこと

一昨日に開催されたJMPの製薬業界向けWebセミナー「非臨床研究者のための統計解析入門」を聴講しました.私にとって馴染みの薄い分野なので,あまり使わない機能を紹介して頂くのは勉強になります.そもそも非臨床研究というのが聞き慣れない言葉だったのですが,話を聞くと動物などを使った医薬品の薬効や安全性の検証試験である前臨床試験のことなんですね.最近では非臨床試験と呼ばれていることは知りませんでした.非というのは良い響きではないのですが,おそらく英語のNon-clinicalを直訳したのでしょうか.工業分野の実験計画とは大きく異なって,試験の手順や分析方法,信頼性検証に至るまでがガイドラインでガチガ...
JMP

ポストコロナの適者生存

5月,6月と開催されていたJMP On Airも今週で終了となりました.コロナ期間中は自宅で楽しみながら勉強させていただきました.あらためてSAS社の皆様にお礼をしたいと思います.第一回の開催ではまだオンライン視聴に慣れていなかったということもあって,少しドキドキしてスタートを待ったのは良い思い出です.1時間もヘッドセットをつけているのは辛いので,スピーカーから音を出しても邪魔にならない場所に移動して視聴していたのですが,当初は自宅の通信状態が安定せず,時々音声が途切れがちになったりして苦労しました.自宅のWifiは5GHzと2.4GHzを使い分けているのですが,調べるとその切り替えが物理的...
JMPではじめるデータサイエンス

検査の損益に付いて考える

先々週のブログで,PCR検査は検査というよりも,仮説検定と同じテストであるとみなすべきと書きました.もちろん,同じテストだと言っても,確率に基づいた判定ではないという点では,仮説検定とは厳密には違います.ではありますが,試行の結果(イベント)を真実と判断結果の四分割表に割り当てる手法であると緩く考えるとPCR検査の実態をより深く理解することができます.4つの領域は「あたり」と「はずれ」が半々ですが,このうちの2つの「はずれ」が意思決定手法としての評価に特に重要です.仮説検定では,それらを第一種の過誤と第二種の過誤と呼ぶわけですが,この命名では両者の違いがわかりにくいと思いませんか.英語でも,...
JMP

検査とテスト

今日は一日,統計リテラシーのオンライン用スライドを作成していました.オンライン向けにはアニメーションを使うのを避けたり,フォントサイズを小さめにしたりする以外にも,話の間をとるという工夫が必要です.セミナーのコンテンツは使い回す人も多いのですが,私の場合,基本的にスライドはその度に組み直します.今度はどんな相手にどんな話をしようか考えるのが楽しみの一つでもありますし,そもそも同じスライドを使っていると,自分が飽きてしまうのです.今回は,オンライン版として作り直すにあたり,せっかくなので最近の関心事からネタを拾って,コンテンツを更新しています.正直に申し上げると,コロナのことにも飽きてきた(こ...
覚え書き

とあるJMPユーザーのニューノーマル

日々の東京の感染者数に一喜一憂している昨今ですが,しばらくはこの調子が続くのでしょうね.(第一波に限ってではありますが)少くとも,西浦先生が指摘されていた「対策なければ40万人死亡」という事態は回避できたようです.今にして思えば,この先生の発言もメディアの不完全な報道で批判を受けました.この推定は「対策を取らなければ」という前提のもとでの試算なのです.先生もこの発言の後に「40万人が亡くなるとは想定していない。この感染症は人との接触を大幅に削減すれば流行を止めることができる」と言われていたのですが,メディアによっては,その部分をうまく伝えていませんでした.例えば,毎日新聞は「対策なければ重篤8...
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A型人間はコロナにかかりやすいのか?

冒頭から如何わしいタイトルで恐縮です.血液型と性格の関係がどうこうという話ではないのでご容赦ください.様々なデマ情報も飛び交っている昨今では,それら情報の裏を取るという必要があり,ここのところ色々な文献を読みまくっています.311の当時を思い出す状況です.あのときも随分と勉強しました.このときの蓄えがなければ,おそらく『JMPではじめる統計的問題解決入門』は執筆していなかったかもしれません.p46の「ネ申エクセルの話」というコラムにも当時のことを書いていますけど,あの頃色々と勉強したことが集積していって,それが書籍として実態化したように思います. さて,ここのところコロナをネタにしていて,先...
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災難に逢ふ時節には災難に逢ふがよく候

先週予告したように,本日は新型コロナウィルス感染者の状況を中国,イタリアと比較しようと考えていました.ですが,イタリアの状況がデータを取るまでもなく酷くなってきていて,指数関数のグラフを見るに忍びないので,変更させてください.自転車と万年筆を愛する自分にとって,イタリアは特別な国なのです.(中国ならいいのかと言われれば,もちろん,そんなわけではないですよ.)ただ,どうしても気が乗らないのです.今年のジロは中止でしょうね... そもそもコロナウィルスをブログ題材にするのにも気が引けるように思えてきました.自分に興味のあるデータ分析の対象として扱っているだけなのですが,明らかに,ここ最近のビュー...
JMP

新型コロナを題材に補講します

本日は,新型コロナを題材に『JMPではじめるデータサイエンス』の補講をします.p54の『シロかクロか?」を開いてください.何かと話題になっているPCR検査について検査的中率を求めてみることにします.必要になるのは,偽陽性率と偽陰性率というPCR検査の性能と事前確率,即ち被験者が感染しているであろう確率です.最初に偽陽性率と偽陰性率を調べてみます.専門家が,口々にPCR検査は絶対ではないと言っているものの,それがどの程度なのか具体的な数字は見つけることができませんでした. ウィルス検査の偽陽性率についての文献はインターネット検索のレベルでもいくつか上がってきますが,例えば,この文献では,P...